Komiya Tohru

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Title

Associate Professor

Laboratory location

Sugimoto Campus

Degree 【 display / non-display

  • The University of Tokyo -  Doctor of Medicine

Research Areas 【 display / non-display

molecular morphology, Morphology/Structure, genetic engineering

Research subject summary 【 display / non-display

  • About 20,000 genes of mammals such as humans and mice are estimated. Among them, less than 10,000 genes are known to function. In the post-genome era, methods for efficiently isolating important genes from unknown treasures are highly desired. We devised a method for exhaustive isolation of genes that show tissue area / cell specific expression called rapid in situ hybridization. We are using it to promote isolation of biologically and medically important genes.

Research Interests 【 display / non-display

Developmental biology, Molecular biology, Gene expression

Research Career 【 display / non-display

  • Construction of gene expression database

    (Individual)

    Keyword in research subject:  gene expression

Education summary 【 display / non-display

  • The purpose is to decipher phenomena such as induction revealed by classical developmental biology in modern molecular biology language. In addition, I would like to introduce the latest findings in organogenesis, and clarify the points that have been clarified and future research issues.

Association Memberships 【 display / non-display

  • The Molecular Biology Society of Japan

  • The Japanese Society of Developmental Biologists

Current Career 【 display / non-display

  • Osaka City University   Graduate School of Science   Biology and Geosciences Course   Associate Professor  

Graduate School 【 display / non-display

  •  
    -
    1991

    The University of Tokyo  Graduate School, Division of Medicine 

  •  
    -
    1987

    Chiba University  Graduate School, Division of Natural Science 

Graduating School 【 display / non-display

  •  
    -
    1983

    Chiba University   Faculty of Science  

 

Published Papers 【 display / non-display

  • Xenopus Vasa Homolog XVLG1 is Essential for Migration and Survival of Primordial Germ Cells

    Shimaoka Kazumi, Mukumoto Yoshiko, Tanigawa Yoko, Komiya Tohru

    ZOOLOGICAL SCIENCE  34 ( 2 ) 93 - 104 2017.04  [Refereed]

    DOI

  • Cell-Mass Structures Expressing the Aromatase Gene Cyp19a1 Lead to Ovarian Cavities in Xenopus laevis

    Mawaribuchi Shuuji, Ikeda Nozomi, Fujitani Kazuko, Ito Yuzuru, Onuma Yasuko, Komiya Tohru, Takamatsu Nobuhiko, Ito Michihiko

    ENDOCRINOLOGY  155 ( 10 ) 3996 - 4005 2014.10  [Refereed]

    DOI

  • Cytoglobin is expressed in hepatic stellate cells, but not in myofibroblasts, in normal and fibrotic human liver

    Motoyama Hiroyuki, Komiya Tohru, Le Thi Thanh Thuy, Tamori Akihiro, Enomoto Masaru, Morikawa Hiroyasu, Iwai Shuji, Uchida-Kobayashi Sawako, Fujii Hideki, Hagihara Atsushi, Kawamura Etsushi, Murakami Yoshiki, Yoshizato Katsutoshi, Kawada Norifumi

    LABORATORY INVESTIGATION  94 ( 2 ) 192 - 207 2014.02  [Refereed]

    DOI

  • 杉生新田鉱泉の泉質と微生物による鉱化作用

    磯山 陽子, 益田 晴恵, 前田 俊介, 西川 禎一, 小宮 透

    一般社団法人日本地球化学会 日本地球化学会年会要旨集  58 ( 0 ) 128 - 128 2011  [Refereed]

     View Summary

    【はじめに】兵庫県川辺郡猪名川町は,兵庫県南東部に位置する,森林や田園環境に恵まれた地域である.その地域には,含鉄炭酸食塩泉が湧出している.この冷鉱泉の湧出地点には多くの微生物が生息している.これらの微生物は生物鉱化作用による沈殿物の形成と関係している。本研究では,この鉱泉の泉質と微生物による鉱化作用の関係を明らかにしていく.【結果】 鉱泉水の pH は5.57,電気伝導度174 ms/m,ORP 98 mVでDO は検出されなかった.主な溶存成分は,Cl<sup>-</sup>(328.25 ppm),NO2-(0.089 ppm),SO<sub>4</sub><sup>2-</sup>(4.74 ppm),Fe(7.44 ppm),Mn(0.48 ppm)であった.鉱泉の水質は本来的には嫌気的であるが,湧出時に大気に触れることで,適度に酸化還元電位の高い状態を示している。NO2-の存在は,バクテリア活動が活発であることを示唆している。 SEM-EDSによるバクテリアマットを含む沈殿物の観察では,球菌・桿菌・珪藻類などさまざまな微生物が観察された.また, XRFを用いた分析により,沈殿物はFe2O3 80.76 wt%, SiO<sub>2</sub> 15.52 wt%を主成分としていたが,Ba を5727.0 ppm含むことが特徴的であった.Baは生物濃縮される元素のひとつである. 真正細菌をターゲットにしたプライマーを用いて行ったPCR法による解析では.バクテリアマット中には真正細菌を多量に検出した.さらに,PCRで増幅させた16S rRNAを解析した結果,鉄酸化バクテリアの一種であるGallionella ferrugineaに近縁な種を同定した。この解析により,沈殿物中には,多様なバクテリアが存在していることが明らかになった.【まとめ】 本研究の結果,鉱泉の湧出口付近には,さまざまなバクテリアが棲んでいることが明らかになった.鉱泉水は嫌気的であるが,湧出口付近で大気中酸素を取り込むことにより,様々な酸化還元状態と化学的に多様な環境が出現することに伴って,微生物種の多様性が生じていると推定される。

    DOI CiNii

  • Analysis of SDF-1/CXCR4 signaling in primordial germ cell migration and survival or differentiation in Xenopus laevis

    Takeuchi Tomoyo, Tanigawa Yoko, Minamide Ryohei, Ikenishi Kohji, Komiya Tohru

    MECHANISMS OF DEVELOPMENT  127 ( 1-2 ) 146 - 158 2010  [Refereed]

    DOI

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Review Papers (Misc) 【 display / non-display

  • Construction of gene expression database by the large-scale in situ hybridization

    Genome function    102 - 115 2000

  • In situ hybridization by the 96-well format

    Cell technology  18   405 1999

  • Method to make DIG RNA probe by the 96-well format.

    Cell technology  18   125 1999

Conference Activities & Talks 【 display / non-display

 

Charge of on-campus class subject 【 display / non-display

  • Biology experiment A

    (2018) University, General education courses

  • Advancec animal development

    (2018) Graduate school, Special course

  • Advancec animal development II

    (2018) Graduate school, Special course

  • Exercises in Molecular Biofunctions

    (2018) Graduate school, Special course

  • Molecular developmental biology

    (2018) University, Special course

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Social Contribution 【 display / non-display

  • Laboratory tour guide to students of Shiritu high school

    Role : Others

     Audience : High school students 

    2018.11
     
     

    Sponsor, Organizer, Publisher : Local Contribution Committee 

     View Summary

    I guided the laboratory, introduced the instruments and equipment, and explained the outline of the research.